Głównym celem prowadzonych badań zespołu turystyki KTRiE jest rozpoznanie przyrodniczych, ekonomiczno-społecznych i przestrzennych determinant rozwoju turystyki i rekreacji na obszarach pojeziernych, ze szczególnym uwzględnieniem regionu Warmii i Mazur.

Badania skupiają się m. in. na zagadnieniach dotyczących:

• uwarunkowań rozwoju turystyki w gminach (wiejskich i miejskich);
• możliwości dywersyfikacji działalności gospodarczej zależnej od wód powierzchniowych;
• analizy wpływu prowadzenia działalności gospodarczej w przemyśle czasu wolnego na środowisko społeczne i przyrodnicze;
• określenia uwarunkowań podjęcia i prowadzenia działalności turystycznej i rekreacyjnej na terenach cennych przyrodniczo, w tym na obszarach chronionych;
• analizy przydatności rekreacyjnej jezior oraz procesów osadniczych wokół nich, związanych z użytkowaniem turystyczno-rekreacyjnym;  
• socjoekonomicznych i ekologicznych aspektów wędkarstwa oraz innych form rekreacji i turystyki kwalifikowanej;
• analizy potencjału ekologicznego sztucznych zbiorników i jego związku z potencjałem turystyczno-rekreacyjnym terenów przywodnych.
  

Kierunki badań realizowane w zespole ekologii KTRiE to zagadnienia związane
z hydrobiologicznymi i ekosystemowymi podstawami zrównoważonego gospodarowania wodami śródlądowymi i przejściowymi.

Badania skupiają się m. in. na zagadnieniach dotyczących:

• zależności pomiędzy czynnikami biogeochemicznymi, hydrodynamicznymi i meteorologicznymi, a zespołami fitoplanktonu i zooplanktonu wód przejściowych z wykorzystaniem modelowania statystycznego,
• struktura fitoplanktonu płytkich estuariów i jezior rekultywowanych,
• struktura zooplanktonu płytkich wód słonawych, jezior wypłyconych i zbiorników Zaporowych,
• dynamika i struktura zoobentosu jezior i estuariów oraz rzek i strumieni,
• wpływ zanieczyszczeń wód na organizmy wodne, w szczególności substancji niebezpiecznych pochodzenia organicznego,
• badania cytogenetyczne wybranych gatunków bezkręgowców wodnych,
• badania ekotoksylogiczne organizmów wodnych na poziomie cytogenetycznym,
• fizjologicznym, osobniczym, populacyjnym i ekosystemowym,
• przemiany szaty roślinnej siedlisk wodnych oraz od wód zależnych, 
• wpływ czynników antropogenicznych oraz naturalnych na szatę roślinna,
• zastosowania organizmów wodnych w inżynierii środowiska,
• badanie biocenozy wód silnie zanieczyszczonych i osadu czynnego

Innymi ważnymi w Katedrze obszarami badań i działań praktycznych są:

• badania z zakresu ekologii populacji paprotników,
• dokumentacja i inwentaryzacja gatunków i siedlisk w ramach inicjatywy UE NATURA 2000,
• hydromorfologiczna ocena cieków wodnych,
• hydrochemiczne i hydrobiologiczne uwarunkowania/aspekty funkcjonowania zbiorników wodnych pochodzenia antropogenicznego (zbiorniki technologiczne i poeksploatacyjne w kopalniach węgla brunatnego),
• badania wpływu czynników środowiskowych na przemiany ekosystemów bagiennych,
• zastosowania modelowania równań strukturalnych w badaniach ekologicznych.